Para encontrar um inimigo desconhecido, o agente Phil Coulson reúne um grupo seleto de agentes da organização mundial de defensores da lei conhecida como S.H.I.E.L.D.
Coulson encontra a comandante Camilla Reyes quando ele e seus agentes vão ao Peru investigar um objeto misterioso.
O brilhante cientista Dr. Franklin Hall é sequestrado, e o agente Coulson e equipe da S.H.I.E.L.D. correm contra o tempo para encontrá-lo.
O agente Coulson e sua equipe procuram uma mulher misteriosa que, sozinha, executou vários golpes milionários.
Coulson e equipe tentam resgatar um jovem que tem um poder estranho e perigoso. Skye tem um segredo que ameaça seu relacionamento com a equipe.
Aparecem corpos boiando, e Coulson e os agentes da S.H.I.E.L.D. saem à caça de um assassino astuto. Ninguém está a salvo, nem a própria equipe.
O agente Coulson manipula o sistema para salvar Ward e Fitz, que foram enviados para uma missão secreta nível 8.
Depois dos eventos narrados no longa “Thor: O Mundo Sombrio”, Coulson e a equipe da S.H.I.E.L.D. tentam se recuperar.
Coulson e sua equipe são perseguidos por uma força misteriosa que ameaça destruir a todos. Somente um segredo do passado de May pode salvá-los.
Em um suspense chocante, Coulson revida contra a Centopeia, com a ajuda de Mike Peterson para dar uma força de supersoldado.
Coulson descobre informações cruciais sobre o mistério de sua morte, mas, com a Centopeia querendo sangue, a informação pode custar muito caro.
Coulson e May descobrem informações chocantes sobre o passado de Skye, enquanto a equipe é atingida por uma tempestade na Academia S.H.I.E.L.D.
Nos calcanhares de Clarividente, Coulson e equipe embarcam em um trem misterioso, que parece estar seguindo para uma morte certa.
Tentando salvar Skye, Coulson convoca a ajuda do antigo supervisor de Ward e descobre verdades surpreendentes sobre ele mesmo e sobre a S.H.I.E.L.D.
A mortal e sedutora Lorelei ataca Coulson e a equipe. Lady Sif, amante de Thor e arqui-inimiga de Lorelei, tentará salvá-los.
Os agentes Garrett e Triplett estão de volta para ajudar a equipe de Coulson a encontrar o nefasto inimigo da S.H.I.E.L.D.: o Clarividente.
Coulson e sua equipe percebem que não podem confiar em ninguém e descobrem que há um traidor entre eles.
Como o coronel Glenn Talbot em seu encalço, Coulson e o time procuram refúgio no último lugar que alguém espera, onde eles começam a descobrir os mais perigosos segredos da S.H.I.E.L.D., algo capaz de destruir a todos.
Quando a vida do verdadeiro amor de Coulson é ameaçada pela Hydra, a equipe parte em uma missão perigosa para salvá-la.
A agente Maria Hill volta para ajudar Coulson enquanto o que resta da S.H.I.E.L.D. desmorona sob os ataques da Hydra.
Ward recorda seu primeiro encontro com Garrett, enquanto Coulson e May infiltram-se na Cybertek e descobrem detalhes do passado de Garrett no Projeto Deathlok.
Com sua equipe duramente enfraquecida, Coulson faz tudo o que pode para acabar com Garrett e com as forças da Hydra.